Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Snx27Q3UHD6 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Snx27Q3UHD6 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Snx27Q3UHD6 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Snx27Q3UHD6 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Snx27Q3UHD6 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Snx27Q3UHD6 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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