Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHB8

Ccdc177, Coiled-coil domain-containing protein 177, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc177Q3UHB8 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc177Q3UHB8 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc177Q3UHB8 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc177Q3UHB8 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc177Q3UHB8 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc177Q3UHB8 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc177Q3UHB8 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc177Q3UHB8 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc177Q3UHB8 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc177Q3UHB8 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc177Q3UHB8 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc177Q3UHB8 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc177Q3UHB8 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc177Q3UHB8 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc177Q3UHB8 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc177Q3UHB8 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc177Q3UHB8 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc177Q3UHB8 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc177Q3UHB8 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc177Q3UHB8 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc177Q3UHB8 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc177Q3UHB8 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc177Q3UHB8 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc177Q3UHB8 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc177Q3UHB8 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc177Q3UHB8 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc177Q3UHB8 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc177Q3UHB8 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc177Q3UHB8 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc177Q3UHB8 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc177Q3UHB8 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc177Q3UHB8 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc177Q3UHB8 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc177Q3UHB8 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc177Q3UHB8 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc177Q3UHB8 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc177Q3UHB8 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc177Q3UHB8 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc177Q3UHB8 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc177Q3UHB8 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc177Q3UHB8 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc177Q3UHB8 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc177Q3UHB8 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc177Q3UHB8 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc177Q3UHB8 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc177Q3UHB8 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc177Q3UHB8 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc177Q3UHB8 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc177Q3UHB8 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc177Q3UHB8 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc177Q3UHB8 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc177Q3UHB8 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc177Q3UHB8 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc177Q3UHB8 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc177Q3UHB8 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc177Q3UHB8 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc177Q3UHB8 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc177Q3UHB8 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc177Q3UHB8 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc177Q3UHB8 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc177Q3UHB8 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc177Q3UHB8 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc177Q3UHB8 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc177Q3UHB8 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc177Q3UHB8 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc177Q3UHB8 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc177Q3UHB8 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc177Q3UHB8 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc177Q3UHB8 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc177Q3UHB8 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc177Q3UHB8 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc177Q3UHB8 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc177Q3UHB8 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc177Q3UHB8 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc177Q3UHB8 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc177Q3UHB8 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc177Q3UHB8 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc177Q3UHB8 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc177Q3UHB8 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc177Q3UHB8 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc177Q3UHB8 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc177Q3UHB8 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc177Q3UHB8 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc177Q3UHB8 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc177Q3UHB8 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc177Q3UHB8 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc177Q3UHB8 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc177Q3UHB8 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc177Q3UHB8 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc177Q3UHB8 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc177Q3UHB8 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc177Q3UHB8 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc177Q3UHB8 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc177Q3UHB8 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc177Q3UHB8 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc177Q3UHB8 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc177Q3UHB8 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc177Q3UHB8 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc177Q3UHB8 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc177Q3UHB8 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms