Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9G9

Lbr, Lamin-B receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LbrQ3U9G9 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LbrQ3U9G9 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LbrQ3U9G9 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LbrQ3U9G9 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LbrQ3U9G9 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LbrQ3U9G9 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LbrQ3U9G9 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LbrQ3U9G9 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LbrQ3U9G9 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LbrQ3U9G9 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LbrQ3U9G9 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LbrQ3U9G9 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LbrQ3U9G9 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LbrQ3U9G9 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LbrQ3U9G9 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LbrQ3U9G9 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LbrQ3U9G9 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LbrQ3U9G9 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LbrQ3U9G9 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LbrQ3U9G9 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LbrQ3U9G9 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LbrQ3U9G9 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LbrQ3U9G9 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LbrQ3U9G9 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LbrQ3U9G9 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LbrQ3U9G9 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LbrQ3U9G9 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LbrQ3U9G9 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LbrQ3U9G9 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LbrQ3U9G9 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LbrQ3U9G9 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LbrQ3U9G9 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LbrQ3U9G9 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LbrQ3U9G9 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LbrQ3U9G9 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LbrQ3U9G9 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
LbrQ3U9G9 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LbrQ3U9G9 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LbrQ3U9G9 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LbrQ3U9G9 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LbrQ3U9G9 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LbrQ3U9G9 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LbrQ3U9G9 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
LbrQ3U9G9 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LbrQ3U9G9 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LbrQ3U9G9 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LbrQ3U9G9 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LbrQ3U9G9 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
LbrQ3U9G9 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LbrQ3U9G9 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LbrQ3U9G9 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LbrQ3U9G9 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LbrQ3U9G9 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LbrQ3U9G9 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LbrQ3U9G9 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LbrQ3U9G9 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
LbrQ3U9G9 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
LbrQ3U9G9 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
LbrQ3U9G9 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LbrQ3U9G9 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LbrQ3U9G9 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LbrQ3U9G9 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LbrQ3U9G9 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LbrQ3U9G9 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LbrQ3U9G9 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LbrQ3U9G9 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LbrQ3U9G9 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LbrQ3U9G9 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LbrQ3U9G9 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LbrQ3U9G9 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LbrQ3U9G9 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
LbrQ3U9G9 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LbrQ3U9G9 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LbrQ3U9G9 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LbrQ3U9G9 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LbrQ3U9G9 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LbrQ3U9G9 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
LbrQ3U9G9 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LbrQ3U9G9 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LbrQ3U9G9 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LbrQ3U9G9 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LbrQ3U9G9 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LbrQ3U9G9 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LbrQ3U9G9 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LbrQ3U9G9 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LbrQ3U9G9 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LbrQ3U9G9 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LbrQ3U9G9 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LbrQ3U9G9 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LbrQ3U9G9 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LbrQ3U9G9 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LbrQ3U9G9 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LbrQ3U9G9 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LbrQ3U9G9 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LbrQ3U9G9 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LbrQ3U9G9 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LbrQ3U9G9 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LbrQ3U9G9 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LbrQ3U9G9 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LbrQ3U9G9 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.2 ms