Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Q3U6N9 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Q3U6N9 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q3U6N9 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q3U6N9 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q3U6N9 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Q3U6N9 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Q3U6N9 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Q3U6N9 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Q3U6N9 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Q3U6N9 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms