Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U595 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U595 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U595 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U595 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U595 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U595 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U595 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U595 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U595 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U595 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U595 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U595 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U595 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U595 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U595 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U595 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U595 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U595 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U595 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U595 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U595 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U595 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U595 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U595 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U595 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U595 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U595 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U595 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U595 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U595 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U595 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U595 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U595 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U595 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U595 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U595 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U595 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U595 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U595 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U595 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U595 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U595 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U595 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U595 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U595 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U595 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U595 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U595 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U595 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U595 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U595 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U595 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U595 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U595 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U595 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U595 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U595 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U595 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U595 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U595 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U595 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U595 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U595 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U595 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U595 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U595 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U595 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U595 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U595 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U595 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U595 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U595 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U595 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U595 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U595 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U595 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U595 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U595 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U595 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U595 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U595 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U595 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U595 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U595 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U595 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U595 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U595 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U595 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U595 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U595 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U595 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U595 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U595 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U595 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U595 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U595 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U595 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U595 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U595 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms