Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms