Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms