Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Usp39Q3TIX9 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Usp39Q3TIX9 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Usp39Q3TIX9 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Usp39Q3TIX9 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Usp39Q3TIX9 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Usp39Q3TIX9 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Usp39Q3TIX9 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
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