Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD16

Rubcnl, Protein RUBCNL-like, mousemouse

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Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnlQ3TD16 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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