Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hddc2Q3SXD3 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hddc2Q3SXD3 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hddc2Q3SXD3 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hddc2Q3SXD3 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hddc2Q3SXD3 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hddc2Q3SXD3 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hddc2Q3SXD3 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hddc2Q3SXD3 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hddc2Q3SXD3 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hddc2Q3SXD3 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Hddc2Q3SXD3 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Hddc2Q3SXD3 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Hddc2Q3SXD3 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hddc2Q3SXD3 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Hddc2Q3SXD3 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Hddc2Q3SXD3 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Hddc2Q3SXD3 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Hddc2Q3SXD3 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Hddc2Q3SXD3 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Hddc2Q3SXD3 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hddc2Q3SXD3 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hddc2Q3SXD3 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hddc2Q3SXD3 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hddc2Q3SXD3 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hddc2Q3SXD3 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hddc2Q3SXD3 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hddc2Q3SXD3 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hddc2Q3SXD3 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hddc2Q3SXD3 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hddc2Q3SXD3 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hddc2Q3SXD3 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hddc2Q3SXD3 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hddc2Q3SXD3 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hddc2Q3SXD3 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hddc2Q3SXD3 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hddc2Q3SXD3 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hddc2Q3SXD3 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hddc2Q3SXD3 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hddc2Q3SXD3 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hddc2Q3SXD3 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hddc2Q3SXD3 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hddc2Q3SXD3 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hddc2Q3SXD3 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hddc2Q3SXD3 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hddc2Q3SXD3 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hddc2Q3SXD3 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hddc2Q3SXD3 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hddc2Q3SXD3 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hddc2Q3SXD3 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hddc2Q3SXD3 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hddc2Q3SXD3 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hddc2Q3SXD3 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hddc2Q3SXD3 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hddc2Q3SXD3 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms