Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VgfQ0VGU4 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
VgfQ0VGU4 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VgfQ0VGU4 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VgfQ0VGU4 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
VgfQ0VGU4 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VgfQ0VGU4 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
VgfQ0VGU4 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VgfQ0VGU4 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VgfQ0VGU4 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
VgfQ0VGU4 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VgfQ0VGU4 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VgfQ0VGU4 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VgfQ0VGU4 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VgfQ0VGU4 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
VgfQ0VGU4 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VgfQ0VGU4 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VgfQ0VGU4 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VgfQ0VGU4 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VgfQ0VGU4 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VgfQ0VGU4 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VgfQ0VGU4 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VgfQ0VGU4 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VgfQ0VGU4 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
VgfQ0VGU4 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VgfQ0VGU4 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VgfQ0VGU4 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VgfQ0VGU4 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
VgfQ0VGU4 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VgfQ0VGU4 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VgfQ0VGU4 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VgfQ0VGU4 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VgfQ0VGU4 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VgfQ0VGU4 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VgfQ0VGU4 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VgfQ0VGU4 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VgfQ0VGU4 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VgfQ0VGU4 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VgfQ0VGU4 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VgfQ0VGU4 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VgfQ0VGU4 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VgfQ0VGU4 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VgfQ0VGU4 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VgfQ0VGU4 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VgfQ0VGU4 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VgfQ0VGU4 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VgfQ0VGU4 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
VgfQ0VGU4 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
VgfQ0VGU4 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
VgfQ0VGU4 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VgfQ0VGU4 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VgfQ0VGU4 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VgfQ0VGU4 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VgfQ0VGU4 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VgfQ0VGU4 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
VgfQ0VGU4 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
VgfQ0VGU4 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VgfQ0VGU4 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VgfQ0VGU4 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
VgfQ0VGU4 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VgfQ0VGU4 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VgfQ0VGU4 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VgfQ0VGU4 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VgfQ0VGU4 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VgfQ0VGU4 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VgfQ0VGU4 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VgfQ0VGU4 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VgfQ0VGU4 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VgfQ0VGU4 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VgfQ0VGU4 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VgfQ0VGU4 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
VgfQ0VGU4 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VgfQ0VGU4 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VgfQ0VGU4 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VgfQ0VGU4 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VgfQ0VGU4 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VgfQ0VGU4 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VgfQ0VGU4 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VgfQ0VGU4 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VgfQ0VGU4 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VgfQ0VGU4 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VgfQ0VGU4 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VgfQ0VGU4 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VgfQ0VGU4 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VgfQ0VGU4 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
VgfQ0VGU4 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
VgfQ0VGU4 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VgfQ0VGU4 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VgfQ0VGU4 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
VgfQ0VGU4 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VgfQ0VGU4 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
VgfQ0VGU4 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VgfQ0VGU4 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
VgfQ0VGU4 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VgfQ0VGU4 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VgfQ0VGU4 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VgfQ0VGU4 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VgfQ0VGU4 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VgfQ0VGU4 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VgfQ0VGU4 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms