Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms