Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms