Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms