Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tgm3Q08189 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tgm3Q08189 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tgm3Q08189 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tgm3Q08189 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tgm3Q08189 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tgm3Q08189 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tgm3Q08189 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tgm3Q08189 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tgm3Q08189 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tgm3Q08189 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tgm3Q08189 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tgm3Q08189 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tgm3Q08189 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tgm3Q08189 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tgm3Q08189 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tgm3Q08189 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tgm3Q08189 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tgm3Q08189 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tgm3Q08189 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tgm3Q08189 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tgm3Q08189 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tgm3Q08189 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tgm3Q08189 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tgm3Q08189 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tgm3Q08189 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tgm3Q08189 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tgm3Q08189 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tgm3Q08189 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tgm3Q08189 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tgm3Q08189 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tgm3Q08189 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tgm3Q08189 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tgm3Q08189 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Tgm3Q08189 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Tgm3Q08189 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tgm3Q08189 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tgm3Q08189 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Tgm3Q08189 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tgm3Q08189 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Tgm3Q08189 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tgm3Q08189 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Tgm3Q08189 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tgm3Q08189 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tgm3Q08189 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tgm3Q08189 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tgm3Q08189 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tgm3Q08189 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tgm3Q08189 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tgm3Q08189 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tgm3Q08189 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tgm3Q08189 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tgm3Q08189 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tgm3Q08189 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tgm3Q08189 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tgm3Q08189 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Tgm3Q08189 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tgm3Q08189 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tgm3Q08189 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tgm3Q08189 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tgm3Q08189 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tgm3Q08189 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tgm3Q08189 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tgm3Q08189 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tgm3Q08189 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tgm3Q08189 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tgm3Q08189 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tgm3Q08189 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tgm3Q08189 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tgm3Q08189 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tgm3Q08189 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tgm3Q08189 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tgm3Q08189 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tgm3Q08189 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tgm3Q08189 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tgm3Q08189 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tgm3Q08189 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tgm3Q08189 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tgm3Q08189 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tgm3Q08189 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tgm3Q08189 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tgm3Q08189 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tgm3Q08189 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tgm3Q08189 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tgm3Q08189 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tgm3Q08189 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tgm3Q08189 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tgm3Q08189 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tgm3Q08189 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tgm3Q08189 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Tgm3Q08189 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Tgm3Q08189 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tgm3Q08189 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tgm3Q08189 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tgm3Q08189 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tgm3Q08189 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tgm3Q08189 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tgm3Q08189 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tgm3Q08189 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tgm3Q08189 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms