Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
MestQ07646 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
MestQ07646 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
MestQ07646 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
MestQ07646 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
MestQ07646 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
MestQ07646 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
MestQ07646 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
MestQ07646 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
MestQ07646 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
MestQ07646 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
MestQ07646 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
MestQ07646 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
MestQ07646 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
MestQ07646 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
MestQ07646 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
MestQ07646 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
MestQ07646 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
MestQ07646 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
MestQ07646 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
MestQ07646 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
MestQ07646 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
MestQ07646 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
MestQ07646 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
MestQ07646 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
MestQ07646 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
MestQ07646 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
MestQ07646 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
MestQ07646 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
MestQ07646 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
MestQ07646 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
MestQ07646 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
MestQ07646 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
MestQ07646 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
MestQ07646 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
MestQ07646 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
MestQ07646 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
MestQ07646 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
MestQ07646 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
MestQ07646 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
MestQ07646 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
MestQ07646 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
MestQ07646 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
MestQ07646 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
MestQ07646 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
MestQ07646 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
MestQ07646 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
MestQ07646 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
MestQ07646 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
MestQ07646 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
MestQ07646 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
MestQ07646 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
MestQ07646 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
MestQ07646 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
MestQ07646 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
MestQ07646 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
MestQ07646 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
MestQ07646 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
MestQ07646 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
MestQ07646 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
MestQ07646 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
MestQ07646 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
MestQ07646 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
MestQ07646 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
MestQ07646 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
MestQ07646 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
MestQ07646 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
MestQ07646 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
MestQ07646 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
MestQ07646 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
MestQ07646 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
MestQ07646 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
MestQ07646 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
MestQ07646 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
MestQ07646 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
MestQ07646 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
MestQ07646 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
MestQ07646 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
MestQ07646 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
MestQ07646 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
MestQ07646 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
MestQ07646 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
MestQ07646 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
MestQ07646 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
MestQ07646 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
MestQ07646 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
MestQ07646 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
MestQ07646 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
MestQ07646 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
MestQ07646 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
MestQ07646 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
MestQ07646 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
MestQ07646 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
MestQ07646 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
MestQ07646 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
MestQ07646 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
MestQ07646 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
MestQ07646 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
MestQ07646 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
MestQ07646 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms