Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GscQ02591 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GscQ02591 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GscQ02591 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GscQ02591 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GscQ02591 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GscQ02591 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
GscQ02591 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
GscQ02591 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
GscQ02591 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
GscQ02591 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
GscQ02591 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
GscQ02591 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
GscQ02591 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
GscQ02591 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
GscQ02591 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
GscQ02591 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
GscQ02591 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
GscQ02591 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
GscQ02591 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
GscQ02591 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
GscQ02591 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
GscQ02591 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
GscQ02591 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
GscQ02591 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
GscQ02591 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
GscQ02591 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
GscQ02591 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
GscQ02591 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
GscQ02591 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
GscQ02591 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
GscQ02591 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
GscQ02591 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
GscQ02591 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
GscQ02591 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
GscQ02591 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
GscQ02591 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
GscQ02591 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
GscQ02591 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
GscQ02591 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
GscQ02591 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
GscQ02591 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
GscQ02591 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
GscQ02591 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
GscQ02591 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
GscQ02591 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
GscQ02591 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
GscQ02591 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
GscQ02591 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
GscQ02591 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
GscQ02591 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
GscQ02591 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
GscQ02591 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
GscQ02591 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
GscQ02591 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
GscQ02591 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
GscQ02591 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
GscQ02591 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
GscQ02591 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
GscQ02591 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
GscQ02591 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
GscQ02591 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
GscQ02591 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
GscQ02591 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
GscQ02591 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
GscQ02591 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
GscQ02591 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
GscQ02591 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
GscQ02591 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
GscQ02591 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
GscQ02591 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
GscQ02591 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
GscQ02591 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
GscQ02591 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
GscQ02591 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
GscQ02591 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
GscQ02591 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
GscQ02591 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
GscQ02591 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
GscQ02591 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
GscQ02591 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
GscQ02591 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
GscQ02591 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
GscQ02591 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
GscQ02591 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
GscQ02591 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
GscQ02591 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
GscQ02591 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
GscQ02591 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
GscQ02591 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
GscQ02591 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
GscQ02591 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
GscQ02591 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
GscQ02591 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
GscQ02591 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
GscQ02591 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
GscQ02591 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
GscQ02591 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
GscQ02591 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
GscQ02591 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms