Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms