Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

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Length 535 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Pde1bQ01065 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Pde1bQ01065 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Pde1bQ01065 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Pde1bQ01065 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Pde1bQ01065 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Pde1bQ01065 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Pde1bQ01065 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Pde1bQ01065 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Pde1bQ01065 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Pde1bQ01065 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Pde1bQ01065 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Pde1bQ01065 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Pde1bQ01065 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Pde1bQ01065 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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