Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms