Protein–RNA interactions for Protein: Q00286

Pou1f1, Pituitary-specific positive transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou1f1Q00286 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pou1f1Q00286 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pou1f1Q00286 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pou1f1Q00286 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pou1f1Q00286 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pou1f1Q00286 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pou1f1Q00286 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pou1f1Q00286 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pou1f1Q00286 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pou1f1Q00286 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pou1f1Q00286 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pou1f1Q00286 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pou1f1Q00286 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pou1f1Q00286 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pou1f1Q00286 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pou1f1Q00286 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Pou1f1Q00286 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pou1f1Q00286 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pou1f1Q00286 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pou1f1Q00286 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pou1f1Q00286 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pou1f1Q00286 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pou1f1Q00286 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pou1f1Q00286 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pou1f1Q00286 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pou1f1Q00286 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pou1f1Q00286 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pou1f1Q00286 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Pou1f1Q00286 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pou1f1Q00286 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pou1f1Q00286 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Pou1f1Q00286 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pou1f1Q00286 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pou1f1Q00286 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pou1f1Q00286 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pou1f1Q00286 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Pou1f1Q00286 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Pou1f1Q00286 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Pou1f1Q00286 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pou1f1Q00286 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pou1f1Q00286 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pou1f1Q00286 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pou1f1Q00286 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pou1f1Q00286 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pou1f1Q00286 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pou1f1Q00286 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pou1f1Q00286 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pou1f1Q00286 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pou1f1Q00286 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pou1f1Q00286 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pou1f1Q00286 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pou1f1Q00286 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pou1f1Q00286 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pou1f1Q00286 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pou1f1Q00286 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pou1f1Q00286 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pou1f1Q00286 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pou1f1Q00286 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pou1f1Q00286 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pou1f1Q00286 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pou1f1Q00286 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pou1f1Q00286 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pou1f1Q00286 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pou1f1Q00286 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pou1f1Q00286 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pou1f1Q00286 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pou1f1Q00286 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pou1f1Q00286 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pou1f1Q00286 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pou1f1Q00286 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pou1f1Q00286 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Pou1f1Q00286 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pou1f1Q00286 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Pou1f1Q00286 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pou1f1Q00286 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Pou1f1Q00286 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pou1f1Q00286 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pou1f1Q00286 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pou1f1Q00286 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pou1f1Q00286 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pou1f1Q00286 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pou1f1Q00286 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pou1f1Q00286 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pou1f1Q00286 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pou1f1Q00286 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pou1f1Q00286 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pou1f1Q00286 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pou1f1Q00286 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pou1f1Q00286 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pou1f1Q00286 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pou1f1Q00286 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pou1f1Q00286 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pou1f1Q00286 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pou1f1Q00286 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pou1f1Q00286 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pou1f1Q00286 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou1f1Q00286 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou1f1Q00286 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou1f1Q00286 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou1f1Q00286 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms