Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SbdsP70122 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SbdsP70122 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SbdsP70122 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SbdsP70122 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SbdsP70122 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SbdsP70122 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SbdsP70122 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SbdsP70122 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SbdsP70122 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms