Protein–RNA interactions for Protein: P62751

Rpl23a, 60S ribosomal protein L23a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl23aP62751 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl23aP62751 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl23aP62751 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl23aP62751 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl23aP62751 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl23aP62751 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl23aP62751 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl23aP62751 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl23aP62751 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl23aP62751 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl23aP62751 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl23aP62751 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl23aP62751 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl23aP62751 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl23aP62751 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl23aP62751 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl23aP62751 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl23aP62751 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl23aP62751 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl23aP62751 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl23aP62751 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl23aP62751 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl23aP62751 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl23aP62751 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rpl23aP62751 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rpl23aP62751 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rpl23aP62751 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rpl23aP62751 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rpl23aP62751 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rpl23aP62751 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rpl23aP62751 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rpl23aP62751 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rpl23aP62751 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rpl23aP62751 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rpl23aP62751 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl23aP62751 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl23aP62751 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl23aP62751 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl23aP62751 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl23aP62751 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl23aP62751 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl23aP62751 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl23aP62751 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl23aP62751 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl23aP62751 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl23aP62751 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl23aP62751 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl23aP62751 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl23aP62751 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl23aP62751 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl23aP62751 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl23aP62751 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl23aP62751 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl23aP62751 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl23aP62751 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl23aP62751 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl23aP62751 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl23aP62751 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl23aP62751 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl23aP62751 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl23aP62751 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl23aP62751 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl23aP62751 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl23aP62751 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl23aP62751 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl23aP62751 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl23aP62751 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl23aP62751 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl23aP62751 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl23aP62751 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl23aP62751 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl23aP62751 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl23aP62751 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl23aP62751 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl23aP62751 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl23aP62751 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl23aP62751 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl23aP62751 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl23aP62751 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl23aP62751 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl23aP62751 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl23aP62751 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl23aP62751 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl23aP62751 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl23aP62751 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl23aP62751 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl23aP62751 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl23aP62751 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl23aP62751 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl23aP62751 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl23aP62751 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl23aP62751 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl23aP62751 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl23aP62751 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl23aP62751 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl23aP62751 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl23aP62751 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl23aP62751 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl23aP62751 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl23aP62751 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms