Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
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