Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

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Length 196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Vbp1P61759 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Vbp1P61759 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Vbp1P61759 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Vbp1P61759 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Vbp1P61759 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Vbp1P61759 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Vbp1P61759 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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