Protein–RNA interactions for Protein: P59242

Cgn, Cingulin, mousemouse

Predictions only

Length 1,191 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CgnP59242 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CgnP59242 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CgnP59242 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CgnP59242 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CgnP59242 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CgnP59242 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CgnP59242 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CgnP59242 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CgnP59242 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CgnP59242 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CgnP59242 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CgnP59242 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CgnP59242 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CgnP59242 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CgnP59242 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CgnP59242 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CgnP59242 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CgnP59242 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CgnP59242 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CgnP59242 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CgnP59242 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CgnP59242 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CgnP59242 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CgnP59242 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CgnP59242 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CgnP59242 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CgnP59242 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CgnP59242 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CgnP59242 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CgnP59242 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CgnP59242 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CgnP59242 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CgnP59242 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CgnP59242 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CgnP59242 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CgnP59242 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CgnP59242 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CgnP59242 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CgnP59242 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CgnP59242 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CgnP59242 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CgnP59242 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CgnP59242 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CgnP59242 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CgnP59242 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CgnP59242 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CgnP59242 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CgnP59242 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CgnP59242 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CgnP59242 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CgnP59242 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CgnP59242 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CgnP59242 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CgnP59242 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CgnP59242 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CgnP59242 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CgnP59242 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CgnP59242 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CgnP59242 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CgnP59242 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CgnP59242 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CgnP59242 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CgnP59242 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CgnP59242 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CgnP59242 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CgnP59242 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CgnP59242 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CgnP59242 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CgnP59242 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CgnP59242 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CgnP59242 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CgnP59242 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CgnP59242 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CgnP59242 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CgnP59242 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CgnP59242 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CgnP59242 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CgnP59242 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CgnP59242 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CgnP59242 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CgnP59242 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CgnP59242 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CgnP59242 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CgnP59242 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CgnP59242 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CgnP59242 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CgnP59242 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CgnP59242 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CgnP59242 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CgnP59242 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CgnP59242 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CgnP59242 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CgnP59242 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CgnP59242 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CgnP59242 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CgnP59242 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CgnP59242 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CgnP59242 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CgnP59242 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CgnP59242 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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