Protein–RNA interactions for Protein: P59054

Csrnp1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp1P59054 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csrnp1P59054 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csrnp1P59054 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csrnp1P59054 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csrnp1P59054 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csrnp1P59054 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csrnp1P59054 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csrnp1P59054 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csrnp1P59054 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csrnp1P59054 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csrnp1P59054 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csrnp1P59054 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Csrnp1P59054 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Csrnp1P59054 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csrnp1P59054 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csrnp1P59054 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csrnp1P59054 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Csrnp1P59054 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Csrnp1P59054 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csrnp1P59054 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csrnp1P59054 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Csrnp1P59054 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csrnp1P59054 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csrnp1P59054 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csrnp1P59054 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csrnp1P59054 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csrnp1P59054 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csrnp1P59054 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csrnp1P59054 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csrnp1P59054 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csrnp1P59054 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csrnp1P59054 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csrnp1P59054 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csrnp1P59054 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csrnp1P59054 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csrnp1P59054 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csrnp1P59054 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Csrnp1P59054 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Csrnp1P59054 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Csrnp1P59054 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Csrnp1P59054 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Csrnp1P59054 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Csrnp1P59054 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Csrnp1P59054 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Csrnp1P59054 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Csrnp1P59054 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Csrnp1P59054 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csrnp1P59054 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csrnp1P59054 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csrnp1P59054 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csrnp1P59054 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csrnp1P59054 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Csrnp1P59054 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Csrnp1P59054 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csrnp1P59054 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Csrnp1P59054 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csrnp1P59054 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Csrnp1P59054 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Csrnp1P59054 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Csrnp1P59054 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csrnp1P59054 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csrnp1P59054 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Csrnp1P59054 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csrnp1P59054 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Csrnp1P59054 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csrnp1P59054 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Csrnp1P59054 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Csrnp1P59054 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csrnp1P59054 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csrnp1P59054 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csrnp1P59054 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csrnp1P59054 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csrnp1P59054 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csrnp1P59054 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csrnp1P59054 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csrnp1P59054 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csrnp1P59054 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csrnp1P59054 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csrnp1P59054 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Csrnp1P59054 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csrnp1P59054 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Csrnp1P59054 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csrnp1P59054 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csrnp1P59054 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csrnp1P59054 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Csrnp1P59054 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Csrnp1P59054 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Csrnp1P59054 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csrnp1P59054 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csrnp1P59054 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Csrnp1P59054 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csrnp1P59054 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csrnp1P59054 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Csrnp1P59054 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Csrnp1P59054 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csrnp1P59054 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csrnp1P59054 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csrnp1P59054 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Csrnp1P59054 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csrnp1P59054 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms