Protein–RNA interactions for Protein: P57784

Snrpa1, U2 small nuclear ribonucleoprotein A', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpa1P57784 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snrpa1P57784 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snrpa1P57784 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snrpa1P57784 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Snrpa1P57784 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snrpa1P57784 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snrpa1P57784 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snrpa1P57784 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Snrpa1P57784 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snrpa1P57784 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snrpa1P57784 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Snrpa1P57784 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snrpa1P57784 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Snrpa1P57784 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snrpa1P57784 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snrpa1P57784 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snrpa1P57784 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snrpa1P57784 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snrpa1P57784 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Snrpa1P57784 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snrpa1P57784 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Snrpa1P57784 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Snrpa1P57784 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snrpa1P57784 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Snrpa1P57784 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Snrpa1P57784 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Snrpa1P57784 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snrpa1P57784 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snrpa1P57784 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snrpa1P57784 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snrpa1P57784 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snrpa1P57784 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snrpa1P57784 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snrpa1P57784 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snrpa1P57784 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snrpa1P57784 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snrpa1P57784 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snrpa1P57784 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snrpa1P57784 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snrpa1P57784 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Snrpa1P57784 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Snrpa1P57784 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snrpa1P57784 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snrpa1P57784 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Snrpa1P57784 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snrpa1P57784 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Snrpa1P57784 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC15.04■□□□□ -0
Snrpa1P57784 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snrpa1P57784 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Snrpa1P57784 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Snrpa1P57784 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Snrpa1P57784 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snrpa1P57784 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Snrpa1P57784 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snrpa1P57784 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Snrpa1P57784 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snrpa1P57784 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Snrpa1P57784 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snrpa1P57784 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snrpa1P57784 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snrpa1P57784 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snrpa1P57784 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Snrpa1P57784 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snrpa1P57784 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Snrpa1P57784 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snrpa1P57784 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Snrpa1P57784 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Snrpa1P57784 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Snrpa1P57784 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Snrpa1P57784 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snrpa1P57784 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snrpa1P57784 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snrpa1P57784 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snrpa1P57784 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Snrpa1P57784 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snrpa1P57784 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Snrpa1P57784 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Snrpa1P57784 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Snrpa1P57784 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Snrpa1P57784 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Snrpa1P57784 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snrpa1P57784 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snrpa1P57784 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snrpa1P57784 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snrpa1P57784 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snrpa1P57784 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Snrpa1P57784 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snrpa1P57784 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snrpa1P57784 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snrpa1P57784 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snrpa1P57784 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snrpa1P57784 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snrpa1P57784 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snrpa1P57784 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snrpa1P57784 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snrpa1P57784 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snrpa1P57784 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Snrpa1P57784 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Snrpa1P57784 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snrpa1P57784 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms