Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
NcstnP57716 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
NcstnP57716 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
NcstnP57716 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
NcstnP57716 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
NcstnP57716 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
NcstnP57716 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
NcstnP57716 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
NcstnP57716 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NcstnP57716 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
NcstnP57716 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NcstnP57716 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NcstnP57716 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NcstnP57716 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NcstnP57716 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NcstnP57716 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NcstnP57716 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NcstnP57716 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
NcstnP57716 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NcstnP57716 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
NcstnP57716 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
NcstnP57716 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
NcstnP57716 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NcstnP57716 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NcstnP57716 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
NcstnP57716 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
NcstnP57716 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NcstnP57716 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
NcstnP57716 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
NcstnP57716 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
NcstnP57716 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
NcstnP57716 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
NcstnP57716 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NcstnP57716 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NcstnP57716 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
NcstnP57716 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
NcstnP57716 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NcstnP57716 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NcstnP57716 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
NcstnP57716 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
NcstnP57716 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NcstnP57716 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NcstnP57716 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NcstnP57716 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NcstnP57716 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NcstnP57716 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NcstnP57716 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NcstnP57716 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NcstnP57716 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NcstnP57716 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NcstnP57716 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NcstnP57716 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NcstnP57716 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NcstnP57716 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NcstnP57716 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NcstnP57716 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NcstnP57716 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NcstnP57716 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
NcstnP57716 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NcstnP57716 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NcstnP57716 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NcstnP57716 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
NcstnP57716 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NcstnP57716 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
NcstnP57716 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NcstnP57716 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NcstnP57716 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
NcstnP57716 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NcstnP57716 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NcstnP57716 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
NcstnP57716 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NcstnP57716 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NcstnP57716 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NcstnP57716 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NcstnP57716 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NcstnP57716 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NcstnP57716 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NcstnP57716 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NcstnP57716 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NcstnP57716 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NcstnP57716 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NcstnP57716 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NcstnP57716 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NcstnP57716 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NcstnP57716 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NcstnP57716 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NcstnP57716 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NcstnP57716 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
NcstnP57716 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
NcstnP57716 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
NcstnP57716 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
NcstnP57716 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
NcstnP57716 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
NcstnP57716 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NcstnP57716 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NcstnP57716 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NcstnP57716 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NcstnP57716 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
NcstnP57716 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NcstnP57716 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms