Protein–RNA interactions for Protein: P56480

Atp5b, ATP synthase subunit beta, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5bP56480 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atp5bP56480 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atp5bP56480 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Atp5bP56480 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atp5bP56480 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atp5bP56480 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atp5bP56480 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Atp5bP56480 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Atp5bP56480 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Atp5bP56480 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atp5bP56480 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atp5bP56480 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atp5bP56480 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atp5bP56480 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atp5bP56480 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atp5bP56480 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atp5bP56480 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atp5bP56480 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atp5bP56480 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Atp5bP56480 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Atp5bP56480 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms