Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gp1bbP56400 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gp1bbP56400 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gp1bbP56400 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gp1bbP56400 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gp1bbP56400 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gp1bbP56400 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gp1bbP56400 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gp1bbP56400 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gp1bbP56400 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gp1bbP56400 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gp1bbP56400 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gp1bbP56400 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gp1bbP56400 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gp1bbP56400 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gp1bbP56400 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gp1bbP56400 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gp1bbP56400 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gp1bbP56400 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gp1bbP56400 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms