Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
FmodP50608 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
FmodP50608 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
FmodP50608 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
FmodP50608 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
FmodP50608 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
FmodP50608 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
FmodP50608 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
FmodP50608 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
FmodP50608 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
FmodP50608 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
FmodP50608 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
FmodP50608 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
FmodP50608 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
FmodP50608 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
FmodP50608 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
FmodP50608 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
FmodP50608 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
FmodP50608 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
FmodP50608 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
FmodP50608 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
FmodP50608 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
FmodP50608 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
FmodP50608 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
FmodP50608 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
FmodP50608 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
FmodP50608 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
FmodP50608 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
FmodP50608 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
FmodP50608 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
FmodP50608 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
FmodP50608 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
FmodP50608 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
FmodP50608 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
FmodP50608 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
FmodP50608 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
FmodP50608 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
FmodP50608 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
FmodP50608 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
FmodP50608 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
FmodP50608 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
FmodP50608 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
FmodP50608 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
FmodP50608 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
FmodP50608 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
FmodP50608 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
FmodP50608 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
FmodP50608 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
FmodP50608 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
FmodP50608 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
FmodP50608 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
FmodP50608 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
FmodP50608 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
FmodP50608 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
FmodP50608 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
FmodP50608 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
FmodP50608 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
FmodP50608 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
FmodP50608 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
FmodP50608 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
FmodP50608 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
FmodP50608 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
FmodP50608 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
FmodP50608 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
FmodP50608 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
FmodP50608 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
FmodP50608 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
FmodP50608 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
FmodP50608 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
FmodP50608 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
FmodP50608 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
FmodP50608 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
FmodP50608 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
FmodP50608 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
FmodP50608 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
FmodP50608 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
FmodP50608 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
FmodP50608 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
FmodP50608 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
FmodP50608 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
FmodP50608 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
FmodP50608 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
FmodP50608 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
FmodP50608 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
FmodP50608 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
FmodP50608 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
FmodP50608 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
FmodP50608 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
FmodP50608 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
FmodP50608 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
FmodP50608 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
FmodP50608 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
FmodP50608 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
FmodP50608 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
FmodP50608 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
FmodP50608 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
FmodP50608 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
FmodP50608 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
FmodP50608 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
FmodP50608 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms