Protein–RNA interactions for Protein: P48759

Ptx3, Pentraxin-related protein PTX3, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx3P48759 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ptx3P48759 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ptx3P48759 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ptx3P48759 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ptx3P48759 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ptx3P48759 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ptx3P48759 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ptx3P48759 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ptx3P48759 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ptx3P48759 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ptx3P48759 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ptx3P48759 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ptx3P48759 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ptx3P48759 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ptx3P48759 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms