Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrprbP47758 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrprbP47758 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrprbP47758 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrprbP47758 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrprbP47758 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrprbP47758 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrprbP47758 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrprbP47758 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrprbP47758 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrprbP47758 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrprbP47758 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrprbP47758 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrprbP47758 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrprbP47758 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrprbP47758 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SrprbP47758 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SrprbP47758 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrprbP47758 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrprbP47758 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrprbP47758 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrprbP47758 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SrprbP47758 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrprbP47758 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrprbP47758 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SrprbP47758 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrprbP47758 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrprbP47758 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SrprbP47758 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrprbP47758 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrprbP47758 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrprbP47758 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrprbP47758 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrprbP47758 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrprbP47758 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrprbP47758 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrprbP47758 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SrprbP47758 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrprbP47758 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrprbP47758 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrprbP47758 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrprbP47758 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrprbP47758 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrprbP47758 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrprbP47758 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrprbP47758 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SrprbP47758 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrprbP47758 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrprbP47758 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrprbP47758 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrprbP47758 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrprbP47758 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrprbP47758 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrprbP47758 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrprbP47758 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SrprbP47758 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrprbP47758 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrprbP47758 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SrprbP47758 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SrprbP47758 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SrprbP47758 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SrprbP47758 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrprbP47758 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrprbP47758 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrprbP47758 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrprbP47758 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrprbP47758 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrprbP47758 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrprbP47758 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrprbP47758 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrprbP47758 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrprbP47758 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrprbP47758 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrprbP47758 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
SrprbP47758 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SrprbP47758 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SrprbP47758 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
SrprbP47758 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SrprbP47758 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SrprbP47758 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SrprbP47758 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SrprbP47758 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SrprbP47758 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SrprbP47758 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SrprbP47758 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SrprbP47758 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SrprbP47758 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
SrprbP47758 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SrprbP47758 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SrprbP47758 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
SrprbP47758 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SrprbP47758 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
SrprbP47758 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SrprbP47758 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SrprbP47758 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
SrprbP47758 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SrprbP47758 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
SrprbP47758 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SrprbP47758 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SrprbP47758 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms