Protein–RNA interactions for Protein: P46935

Nedd4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4P46935 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nedd4P46935 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nedd4P46935 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nedd4P46935 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nedd4P46935 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Nedd4P46935 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nedd4P46935 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nedd4P46935 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nedd4P46935 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nedd4P46935 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nedd4P46935 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nedd4P46935 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Nedd4P46935 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nedd4P46935 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nedd4P46935 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nedd4P46935 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nedd4P46935 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nedd4P46935 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Nedd4P46935 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nedd4P46935 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nedd4P46935 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Nedd4P46935 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nedd4P46935 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nedd4P46935 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nedd4P46935 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nedd4P46935 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nedd4P46935 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nedd4P46935 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Nedd4P46935 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nedd4P46935 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nedd4P46935 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nedd4P46935 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nedd4P46935 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Nedd4P46935 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Nedd4P46935 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Nedd4P46935 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Nedd4P46935 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Nedd4P46935 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Nedd4P46935 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
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Nedd4P46935 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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