Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
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PtgfrP43117 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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PtgfrP43117 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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PtgfrP43117 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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PtgfrP43117 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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PtgfrP43117 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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PtgfrP43117 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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PtgfrP43117 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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PtgfrP43117 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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PtgfrP43117 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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PtgfrP43117 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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PtgfrP43117 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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PtgfrP43117 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
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PtgfrP43117 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
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