Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LtbP41155 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LtbP41155 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LtbP41155 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
LtbP41155 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LtbP41155 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
LtbP41155 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LtbP41155 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LtbP41155 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LtbP41155 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LtbP41155 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
LtbP41155 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
LtbP41155 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
LtbP41155 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
LtbP41155 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
LtbP41155 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LtbP41155 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LtbP41155 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LtbP41155 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LtbP41155 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
LtbP41155 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
LtbP41155 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
LtbP41155 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LtbP41155 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LtbP41155 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
LtbP41155 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
LtbP41155 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LtbP41155 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LtbP41155 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
LtbP41155 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
LtbP41155 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
LtbP41155 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LtbP41155 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LtbP41155 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LtbP41155 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LtbP41155 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LtbP41155 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
LtbP41155 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LtbP41155 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
LtbP41155 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
LtbP41155 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
LtbP41155 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LtbP41155 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LtbP41155 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LtbP41155 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LtbP41155 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LtbP41155 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LtbP41155 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LtbP41155 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LtbP41155 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LtbP41155 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LtbP41155 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LtbP41155 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LtbP41155 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
LtbP41155 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
LtbP41155 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LtbP41155 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
LtbP41155 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
LtbP41155 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
LtbP41155 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
LtbP41155 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
LtbP41155 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
LtbP41155 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
LtbP41155 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LtbP41155 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
LtbP41155 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
LtbP41155 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
LtbP41155 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LtbP41155 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LtbP41155 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LtbP41155 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LtbP41155 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LtbP41155 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LtbP41155 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LtbP41155 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LtbP41155 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LtbP41155 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LtbP41155 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
LtbP41155 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LtbP41155 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
LtbP41155 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LtbP41155 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LtbP41155 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LtbP41155 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LtbP41155 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
LtbP41155 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
LtbP41155 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LtbP41155 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LtbP41155 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LtbP41155 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LtbP41155 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LtbP41155 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LtbP41155 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LtbP41155 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LtbP41155 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LtbP41155 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LtbP41155 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LtbP41155 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LtbP41155 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LtbP41155 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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