Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC8.4□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC8.4□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms