Protein–RNA interactions for Protein: P35293

Rab18, Ras-related protein Rab-18, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab18P35293 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab18P35293 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab18P35293 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab18P35293 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab18P35293 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab18P35293 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab18P35293 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab18P35293 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab18P35293 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab18P35293 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab18P35293 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab18P35293 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab18P35293 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab18P35293 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab18P35293 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab18P35293 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms