Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms