Protein–RNA interactions for Protein: P31315

Gsx1, GS homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsx1P31315 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gsx1P31315 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gsx1P31315 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gsx1P31315 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gsx1P31315 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gsx1P31315 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gsx1P31315 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gsx1P31315 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gsx1P31315 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gsx1P31315 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gsx1P31315 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gsx1P31315 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gsx1P31315 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gsx1P31315 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gsx1P31315 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gsx1P31315 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gsx1P31315 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gsx1P31315 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gsx1P31315 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gsx1P31315 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gsx1P31315 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gsx1P31315 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gsx1P31315 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gsx1P31315 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gsx1P31315 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gsx1P31315 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gsx1P31315 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gsx1P31315 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gsx1P31315 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gsx1P31315 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gsx1P31315 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gsx1P31315 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gsx1P31315 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gsx1P31315 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gsx1P31315 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gsx1P31315 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gsx1P31315 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gsx1P31315 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gsx1P31315 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gsx1P31315 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gsx1P31315 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gsx1P31315 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gsx1P31315 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gsx1P31315 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gsx1P31315 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gsx1P31315 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gsx1P31315 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gsx1P31315 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gsx1P31315 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gsx1P31315 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gsx1P31315 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gsx1P31315 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gsx1P31315 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gsx1P31315 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gsx1P31315 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gsx1P31315 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gsx1P31315 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gsx1P31315 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gsx1P31315 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gsx1P31315 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gsx1P31315 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gsx1P31315 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Gsx1P31315 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gsx1P31315 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gsx1P31315 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
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Gsx1P31315 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gsx1P31315 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gsx1P31315 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Gsx1P31315 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gsx1P31315 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gsx1P31315 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gsx1P31315 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gsx1P31315 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gsx1P31315 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gsx1P31315 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gsx1P31315 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gsx1P31315 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gsx1P31315 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gsx1P31315 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gsx1P31315 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gsx1P31315 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gsx1P31315 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gsx1P31315 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gsx1P31315 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gsx1P31315 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gsx1P31315 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gsx1P31315 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gsx1P31315 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gsx1P31315 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gsx1P31315 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gsx1P31315 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gsx1P31315 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gsx1P31315 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.1 ms