Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
RxraP28700 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
RxraP28700 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
RxraP28700 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
RxraP28700 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
RxraP28700 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
RxraP28700 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
RxraP28700 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
RxraP28700 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
RxraP28700 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
RxraP28700 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
RxraP28700 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
RxraP28700 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
RxraP28700 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
RxraP28700 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
RxraP28700 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
RxraP28700 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
RxraP28700 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
RxraP28700 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
RxraP28700 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
RxraP28700 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
RxraP28700 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
RxraP28700 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
RxraP28700 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
RxraP28700 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
RxraP28700 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
RxraP28700 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
RxraP28700 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
RxraP28700 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
RxraP28700 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
RxraP28700 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
RxraP28700 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
RxraP28700 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
RxraP28700 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
RxraP28700 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
RxraP28700 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
RxraP28700 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
RxraP28700 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
RxraP28700 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
RxraP28700 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
RxraP28700 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
RxraP28700 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
RxraP28700 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
RxraP28700 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
RxraP28700 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
RxraP28700 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
RxraP28700 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
RxraP28700 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
RxraP28700 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
RxraP28700 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
RxraP28700 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
RxraP28700 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
RxraP28700 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
RxraP28700 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
RxraP28700 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
RxraP28700 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
RxraP28700 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
RxraP28700 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
RxraP28700 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
RxraP28700 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
RxraP28700 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
RxraP28700 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
RxraP28700 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
RxraP28700 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
RxraP28700 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
RxraP28700 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
RxraP28700 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
RxraP28700 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
RxraP28700 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
RxraP28700 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
RxraP28700 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
RxraP28700 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
RxraP28700 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
RxraP28700 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
RxraP28700 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
RxraP28700 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
RxraP28700 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
RxraP28700 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
RxraP28700 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
RxraP28700 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
RxraP28700 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
RxraP28700 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
RxraP28700 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
RxraP28700 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
RxraP28700 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
RxraP28700 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
RxraP28700 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
RxraP28700 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
RxraP28700 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
RxraP28700 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
RxraP28700 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
RxraP28700 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
RxraP28700 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
RxraP28700 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
RxraP28700 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
RxraP28700 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
RxraP28700 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
RxraP28700 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
RxraP28700 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
RxraP28700 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
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