Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms