Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Fcer1aP20489 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Fcer1aP20489 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Fcer1aP20489 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Fcer1aP20489 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms