Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms