Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
P20040 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P20040 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P20040 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P20040 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P20040 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P20040 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P20040 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P20040 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P20040 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
P20040 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P20040 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P20040 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P20040 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P20040 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P20040 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P20040 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P20040 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P20040 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P20040 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P20040 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
P20040 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
P20040 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P20040 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P20040 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P20040 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
P20040 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P20040 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P20040 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P20040 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P20040 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
P20040 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P20040 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P20040 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P20040 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P20040 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P20040 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P20040 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P20040 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P20040 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P20040 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P20040 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P20040 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P20040 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P20040 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P20040 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P20040 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P20040 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P20040 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P20040 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P20040 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P20040 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P20040 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
P20040 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P20040 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
P20040 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
P20040 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
P20040 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P20040 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
P20040 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P20040 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
P20040 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P20040 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
P20040 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P20040 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P20040 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P20040 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P20040 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P20040 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
P20040 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P20040 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P20040 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P20040 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P20040 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P20040 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
P20040 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
P20040 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
P20040 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
P20040 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P20040 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
P20040 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
P20040 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P20040 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
P20040 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
P20040 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
P20040 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
P20040 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
P20040 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
P20040 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
P20040 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
P20040 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P20040 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P20040 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
P20040 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P20040 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P20040 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P20040 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P20040 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
P20040 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P20040 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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