Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P10404 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P10404 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P10404 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P10404 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P10404 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P10404 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P10404 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P10404 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P10404 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P10404 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P10404 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P10404 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
P10404 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P10404 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P10404 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P10404 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P10404 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P10404 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P10404 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
P10404 Gm36991-201ENSMUST00000191800 648 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
P10404 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
P10404 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
P10404 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
P10404 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
P10404 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
P10404 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
P10404 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P10404 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P10404 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P10404 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P10404 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P10404 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P10404 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P10404 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P10404 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P10404 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P10404 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P10404 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P10404 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P10404 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P10404 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P10404 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P10404 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P10404 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P10404 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P10404 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P10404 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P10404 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P10404 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P10404 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P10404 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P10404 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P10404 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P10404 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P10404 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P10404 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P10404 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P10404 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P10404 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P10404 Gm45251-201ENSMUST00000209486 1465 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P10404 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P10404 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P10404 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P10404 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P10404 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P10404 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P10404 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P10404 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P10404 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P10404 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P10404 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P10404 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P10404 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P10404 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
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P10404 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P10404 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P10404 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P10404 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P10404 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P10404 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P10404 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P10404 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P10404 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P10404 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P10404 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P10404 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P10404 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P10404 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P10404 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P10404 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P10404 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P10404 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P10404 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P10404 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P10404 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P10404 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P10404 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
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