Protein–RNA interactions for Protein: P10085

Myod1, Myoblast determination protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myod1P10085 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Myod1P10085 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Myod1P10085 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Myod1P10085 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Myod1P10085 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Myod1P10085 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Myod1P10085 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Myod1P10085 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Myod1P10085 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Myod1P10085 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Myod1P10085 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Myod1P10085 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Myod1P10085 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Myod1P10085 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Myod1P10085 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Myod1P10085 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Myod1P10085 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Myod1P10085 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Myod1P10085 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Myod1P10085 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Myod1P10085 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Myod1P10085 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Myod1P10085 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Myod1P10085 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Myod1P10085 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Myod1P10085 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Myod1P10085 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Myod1P10085 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Myod1P10085 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Myod1P10085 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Myod1P10085 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Myod1P10085 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Myod1P10085 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Myod1P10085 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Myod1P10085 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Myod1P10085 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Myod1P10085 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Myod1P10085 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Myod1P10085 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Myod1P10085 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Myod1P10085 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Myod1P10085 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Myod1P10085 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Myod1P10085 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Myod1P10085 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Myod1P10085 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Myod1P10085 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Myod1P10085 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Myod1P10085 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Myod1P10085 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Myod1P10085 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Myod1P10085 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Myod1P10085 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Myod1P10085 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Myod1P10085 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Myod1P10085 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Myod1P10085 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Myod1P10085 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Myod1P10085 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Myod1P10085 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Myod1P10085 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Myod1P10085 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Myod1P10085 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Myod1P10085 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Myod1P10085 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Myod1P10085 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Myod1P10085 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Myod1P10085 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Myod1P10085 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Myod1P10085 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Myod1P10085 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Myod1P10085 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Myod1P10085 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Myod1P10085 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Myod1P10085 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Myod1P10085 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Myod1P10085 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Myod1P10085 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Myod1P10085 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Myod1P10085 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Myod1P10085 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Myod1P10085 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Myod1P10085 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Myod1P10085 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Myod1P10085 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Myod1P10085 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Myod1P10085 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Myod1P10085 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Myod1P10085 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Myod1P10085 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Myod1P10085 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Myod1P10085 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Myod1P10085 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Myod1P10085 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Myod1P10085 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Myod1P10085 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Myod1P10085 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Myod1P10085 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Myod1P10085 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Myod1P10085 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms