Protein–RNA interactions for Protein: P0DM65

Becn2, Beclin-2, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Becn2P0DM65 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms