Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms